电气控制系统是温室喷灌机的控制指挥中枢，主要由时间控制器、变频器、接触器、开关和传感器等组成。 其主要控制功能包括以下几个方面。
1控制模式选择：可根据需要，选择手动/自动/外接接算计控制三种模式工作。自动状态可以根据浇灌要求设定多种工作程序，例如开停机时间，喷水方式选择，喷水间隔和休息时间，工作次数，等等;手动状态可调节运行方向和速度，开停左右喷杆喷水;外接计算机控制状态可以设定转入外部控制状态，接受外部信号控制。
2运行转换：喷灌机运行时，光电开关检测主机运行位置，控制喷灌机前进、后退的转换。
3开停约定：停机停水-除非人工手动，任何情况下机器停止运行的同时停止喷水。开机开水-除非人工手动，任何情况下机器启动运行的同时开始喷水。
4 最大速度：机器在最大速度运行状态下不喷水，亦不接受开关左右喷杆的电磁阀控制信号。
5 强制停机：设置强制停机按钮，用于紧急情况停机。
6供水泵开关控制：输出控制信号，根据开停喷水信息发出启停供水泵信号。
7循环喷水时间间隔(或称休息时间)设置：最多24 h，分辨率为1 min。
8断电保护：原地停机并记忆位置。40 h内重新给电，机器退回起始位置，并按照停电前工作方式重新启动，执行喷灌作业。停电40 h以上则由人工手动恢复机器工作。
